Seit Debian Stretch ist Copy/Paste mit vim (vi improved) eine echt nervige Sache. Mir persönlich ist der Grund nicht wirklich klar und bringt mir einfach keinen Mehrwert.
Global
Um das nervige Verhalten abzustellen ist die Datei /usr/share/vim/vim80/defaults.vim
zu editieren. Circa bei Zeile 79 findet sich folgendes:
if has('mouse')
set mouse=a
endif
Hier ist bei "set mouse" das "a" durch ein "r" zu ersetzen. Alternativ können auch die drei Zeilen auskommentiert werden.
Pro User
Die Datei /usr/share/vim/vim80/defaults.vim
einfach in das Home-Dir des User kopieren als .vimrc. Dort dann die o. g. Zeile ändern. Das hat den Vorteil, dass bei einem Update/Upgrade die Änderung nicht überschrieben wird.